Génomique

@BRIDGe offre plusieurs services dans les domaines de la génomique fonctionnelle et de la génomique structurale.

Dans le cas de la génomique fonctionnelle, deux approches complémentaires sont proposées permettant d’effectuer des études du transcriptome.

  • La première de ces deux approches est constituée par l’Atelier microarrays, qui est basé sur la technologie Agilent. Tous les outils nécessaires au flux de travail (ex. four d’hybridation, scanner) sont disponibles, ainsi qu’un certain nombre de logiciels d’analyse associés (Feature Extraction, GeneSpring, IPA). Plusieurs types de protocoles sont disponibles, en particulier l’analyse du transcriptome, l’analyse du miRNome et les protocoles brin-spécifiques.
  • La deuxième approche proposée est l’Analyse génomique expressionnelle par PCR quantitative en temps réel. Cette méthode simple, rapide, sensible, reproductible et fiable permet de détecter de très faibles quantités d’acides nucléiques (ADN, cDNA ou miRNA) dans une large gamme d’échantillons provenant d’organismes, de tissus ou de cellules très différents.

La plateforme met à disposition des utilisateurs des équipements de pointe et des compétences qui permettent d’accompagnement les utilisateurs tout le long d’un projet ou de réaliser une prestation pour la réalisation de projets en PCRq. Les équipements sont aussi accessibles après formation.

Dans le cas de la génomique structurale, @BRIDGe proposé un service de préparation de librairies pour la capture de régions ciblées. La technologie de la capture de séquence joue un rôle important dans tous les projets qui s’intéressent à l’étude d’une ou plusieurs régions précises d’un génome sur un nombre élevé d’individus. Elle permet une réduction conséquente des coûts, et une augmentation de la profondeur du séquençage sur les régions d’intérêt.

Liste des services en Génomique :

  • Séquençage (4)

    Séquençage

    La plateforme @BRIDGE est équipée depuis mars 2016 d’un séquenceur MiSeq Illumina. L'activité de séquençage est couplée avec la prise en charge des échantillons, incluant l’ extraction d’ADN à partir...

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