Séquençage

Séquençage

La plateforme @BRIDGE est équipée depuis mars 2016 d’un séquenceur MiSeq Illumina.

L'activité de séquençage est couplée avec la prise en charge des échantillons, incluant l’extraction d’ADN à partir de fèces et le stockage longue durée à -80°C par la Biobanque d’@BRIDGe.

La plateforme assure un contrôle qualité sur les échantillons fournis par l’utilisateur avant de lancer toute expérimentation et se réserve le droit de les refuser s’ils ne sont pas conformes aux pré-requis définis (téléchargeable ici – lien avec § 7.6 de la convention de projet).

La plateforme ne fournit pas actuellement de prestation bioinformatique, veuillez nous préciser si vous souhaitez que nous fassions le lien avec une cellule bioinformatique.

 

Données délivrées

La plateforme @BRIDGe fournit à l’utilisateur :

  • Un rapport de séquençage
  • Les données de sortie : fichiers fastq démultiplexés contenant l'ensemble des reads générés par échantillon.

Services proposés :